Uno de los objetivos primarios de la Corporación es crear un gran museo en la comuna de Caldera que reunirá las colecciones científicas, el centro de investigaciones y una exhibición de talla mundial: el Museo Paleontológico de Atacama. Entendemos este Museo no solo como una vitrina educativa, sino también como un centro de conservación de sus colecciones patrimoniales y un motor de investigación científica, cuyo fin es ser un referente para las Ciencias Naturales a nivel mundial.
Éste será heredero del actual Museo Paleontológico de Caldera, creado en 2006, que se emplaza dentro del Centro Cultural Estación Caldera y se encuentra bajo administración municipal. La Corporación tendrá, por tanto, no solo la misión de asumir la administración del actual museo y sus colecciones, sino también la de planificar y ejecutar la creación de un futuro edificio que le dé permanencia y continuidad. Se proyecta que las nuevas dependencias se ubiquen en el área del actual Parque Paleontológico Los Dedos, con el fin de consolidar el sitio como un centro neurálgico de los estudios y cuya presencia se constituya en un ícono tutelar para el resguardo y protección del patrimonio fósil in situ. Se busca así transformar al museo en el principal símbolo del actuar de la Corporación y un polo de atracción de turistas y visitantes a la zona.